Terminologie des peptides expliquée pour les acheteurs techniques

Séquence, résidu et modification

Un peptide est défini par sa séquence d'acides aminés, écrite de l'extrémité N-terminale à l'extrémité C-terminale. La position des résidus est importante car une seule substitution crée une molécule différente avec un numéro CAS différent. Les modifications courantes incluent l'acétylation N-terminale, l'amidation C-terminale, la cyclisation, les ponts disulfure, la PEGylation et l'acylation par acide gras, chacune modifiant la masse, la solubilité et la stabilité.

Pureté versus teneur en peptide

La pureté chromatographique, généralement déterminée par HPLC en phase inverse à une longueur d'onde indiquée, décrit la proportion d'aire de pic attribuable à la cible. La teneur en peptide, déterminée par dosage de l'azote ou analyse des acides aminés, décrit quelle proportion de la poudre physique est effectivement du peptide. Le reste est généralement de l'eau, un contre-ion tel que l'acétate ou le trifluoroacétate, et des sels résiduels. Un matériau peut être pur à 99 pour cent par HPLC et représenter bien moins de 80 pour cent de peptide en masse.

Peptide net et calcul de dosage

Le peptide net correspond à la pureté multipliée par la teneur en peptide. Tout travail quantitatif doit utiliser le peptide net, et non le poids brut du flacon, et le fournisseur doit préciser à quelle base se réfère une quantité indiquée.

Contre-ion et solvant résiduel

Le trifluoroacétate issu de la purification et l'acétate issu de l'échange d'ions se comportent différemment en usage en aval. Demandez quel contre-ion est présent et à quel niveau, et demandez les données de solvants résiduels.

Forme lyophilisée et reconstitution

Le peptide lyophilisé se présente sous forme de gâteau dont l'aspect ne dit que peu de choses sur la qualité. Les conditions de manutention à confirmer sont la température de conservation, la protection contre la lumière et l'humidité, la fermeture du contenant, et l'existence de données de stabilité pour la condition de conservation revendiquée.

Confirmation de l'identité

La spectrométrie de masse confirme la masse moléculaire ; elle ne confirme pas à elle seule l'ordre de la séquence. Lorsque la séquence importe, demandez des données de cartographie peptidique ou de séquençage plutôt que la seule masse.

Terminologie de grade

La mention « usage recherche uniquement » (RUO) est une déclaration relative à l'usage autorisé, non une norme de qualité. Elle n'implique jamais une adéquation à l'administration humaine ou animale.